Cell Signaling Technology

有用的信号通路网站和资源

下面列出了一些网站和资源,可以帮助您规划和开展您的实验。包括抗体资源,蛋白质组学研究工具,疾病和突变数据库,细胞信号转导研究相关网站。

信号转导研究

一个洞察蛋白翻译后修饰的网站 www.phosphosite.org

PhosphoSitePlus®网站是CST美国总公司和美国NIH联合开发的一个免费资源数据库,总结归纳了关于蛋白质磷酸化、甲基化、乙酰化等蛋白质修饰相关的研究成果,并且包括一些CST公司发现但未发表的蛋白质修饰位点。目前该网站包含了30多万海量的蛋白翻译后修饰位点信息,以及25,000 PTMVarsPTMs Impacted by Variants)。CST公司利用PhosphoScan®technology [(2005) Nature Biotech 23, 94–101] 专利技术进行了蛋白质修饰位点的寻找和鉴定工作,相关数据均收录到该数据库。

 

AfCS-Nature Signaling Gateway www.signaling-gateway.org

AfCS-NatureSignaling Gateway 是一个综合信息网站,包括细胞信号通路,细胞信号通路联盟和Nature 出版集团。

 

Scansite scansite.mit.edu

Scansite预测蛋白的磷酸化修饰位点,以及特异的蛋白结构域结合区,MIT

 

NetPhos 2.0 Server www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos

真核蛋白磷酸化位点的神经网络预测,Technical Universityof Denmark

 

Kinase.com www.kinase.com

人、酵母、蠕虫和苍蝇的蛋白激酶分析。

 

AAAS | Science's STKE stke.sciencemag.org

信号转导知识:信号转导的资源和信息,科学杂志和斯坦福大学。需要订阅。

 

BIND - The Biomolecular Interaction Network bond.unleashedinformatics.com

生物分子相互作用网络数据库,包括蛋白质,核酸和小分子相互作用的完整描述。

 

BioCarta - Charting Pathways of Life www.biocarta.com/search/index.asp

"开源资源,提供在线图,展示选择的信号通路。

 

Cell Cycle Regulated Yeast Genes genome www.stanford.edu/cellcycle

识别酵母基因的mRNA 水平,由  Stanford cell cycle 管理。

 

Horst Ibelgaufts’ COPE: Cytokines & CellsOnline Pathfinder Encyclopedia  www.copewithcytokines.org

细胞因子 & Cells EncyclopediaUniversity of Munich

 

GPCRDB: Information system for Gprotein-coupled receptors (GPCRs) www.gpcr.org/7tm

GPCR的信息系统。

 

NetOGlyc 3.1 Server  www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc

在哺乳蛋白中预测GalNAc O-糖基化位点,TechnicalUniversity of Denmark。

 

SenseLab  senselab.med.yale.edu

建立整合的,多学科的神经元和神经系统模型,Yale University

 

Bioinformatics & Biological Computing bip.weizmann.ac.il

广泛阐述‘hot molecules’,这些分子在常见的疾病中发挥关键作用Weizmann Institute

 

在线链接

San Diego超级计算中心:提供网络基础设施 www.sdsc.edu

优秀的分子生物学和蛋白质组学工具和资源,University of California San Diego

 

细胞及分子生物学 www.cellbio.com

细胞与分子生物学信息资源。

 

TIGEM Telethon遗传学和医学研究院 www.tigem.it

表达序列标签分析链接资源,University of Brescia

 

在线出版和文献的搜索引擎

Entrez PubMed  www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed

NLM的搜索服务检索和引文网络,链接其他相关电子期刊数据库,N.I.H

 

PubCrawler Web Service  pubcrawler.gen.tcd.ie/

提醒的免费服务,每日更新扫描到NCBI GenBank MEDLINEGenBank数据库。

 

科学公共图书馆 www.plos.org

努力使世界的科学和医学文被世界各地的科学家和公众自由访问。

 

疾病和基因突变数据库

KinMutBase bioinf.uta.fi/KinMutBase

在酪氨酸激酶域突变导致疾病的数据库,链接其他突变数据库,University of Tampere

 

Atlas Chromosomes in Cancer atlasgeneticsoncology.org

Atlas of Genetics and Cytogenetics,致力于癌症和癌症倾向疾病的生物学和分子方面。

 

OMIM - Online Mendelian Inheritance in Man  www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=OMIM

在线的人类孟德尔遗传:人类基因和遗传性疾病目录,N.I.H

 

人类基因突变数据库(Human Gene Mutation DatabaseHGMD) www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php

人类基因突变数据库,医学遗传研究所,Cardiff

 

OMIM的位点特异性突变数据库链接 www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/allresources.html#LocusSpecific

链接多个位点特异性突变数据库,N.I.H

 

疾病基因 www.ncbi.nlm.nih.gov/disease/

定位于克隆的人类疾病基因的研究,N.I.H

 

CGAP合作 www.ncbi.nlm.nih.gov/ncicgap

肿瘤基因组解析计划:负责癌基因数据库,N.I.H

 

基因敲除和转基因小鼠

JAX Mice Database jaxmice.jax.org/query/

转基因小鼠品系的来源,或有针对性的或化学诱导突变,The Jackson Laboratory

 

基因组数据库

Sanger研究所:人类基因组计划 www.sanger.ac.uk/about/history/hgp/

人类基因组研究计划,Sanger Center

 

TIGR人类基因指数 compbio.dfci.harvard.edu/tgi/

TIGR人类基因指数。

 

www.mitomap.org 文库

人类线粒体基因组,Emory University

 

MGI 3.3小鼠基因组信息 www.informatics.jax.org

小鼠基因组,Jackson Laboratory

 

Berkeley果蝇基因组计划 www.fruitfly.org

果蝇基因组项目,Berkeley

 

Sanger研究所的线虫项目 www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans

线虫基因组,Sanger Center

 

酵母基因组数据库 www.yeastgenome.org

酿酒酵母基因组,Stanford

 

 

 

References